Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4E1Q9UPM8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms