Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms