Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CYP4F12Q9HCS2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms