Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms