Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms