Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms