Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms