Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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