Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN18Q96SJ8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.7 ms