Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms