Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP295NLQ96MC4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms