Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG3Q96JB2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms