Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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