Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHMTQ93088 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms