Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL5Q93034 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms