Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms