Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLEC4CQ8WTT0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms