Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS8Q8N3P4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS8Q8N3P4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms