Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUFY3Q7L099 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms