Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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