Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF2Q5BJF6 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms