Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VWC2Q2TAL6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms