Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms