Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DDB1Q16531 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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DDB1Q16531 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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DDB1Q16531 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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DDB1Q16531 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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DDB1Q16531 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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DDB1Q16531 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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DDB1Q16531 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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DDB1Q16531 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DDB1Q16531 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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