Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP13Q15645 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms