Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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IRF4Q15306 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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IRF4Q15306 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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IRF4Q15306 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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IRF4Q15306 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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IRF4Q15306 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF4Q15306 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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