Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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