Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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