Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTTNQ14247 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms