Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms