Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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