Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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TUBA3CQ13748 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TUBA3CQ13748 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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