Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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