Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms