Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P62684 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms