Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms