Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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CLDN15P56746 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CLDN15P56746 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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