Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CSRP3P50461 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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