Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNTAP49354 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms