Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms