Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms