Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms