Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FGFR3P22607 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms