Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB9P17482 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB9P17482 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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