Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms