Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms