Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms