Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG7O95352 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG7O95352 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms