Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ACSL4O60488 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ACSL4O60488 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ACSL4O60488 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ACSL4O60488 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ACSL4O60488 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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