Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPAG9O60271 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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